More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16961 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  100 
 
 
381 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  64.29 
 
 
371 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  62.13 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  54.26 
 
 
344 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  52.1 
 
 
364 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  52.92 
 
 
351 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  37.78 
 
 
354 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  37.78 
 
 
354 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  37.78 
 
 
354 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  38.81 
 
 
350 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  44.89 
 
 
348 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.73 
 
 
349 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.11 
 
 
349 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.89 
 
 
349 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.38 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.55 
 
 
348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.71 
 
 
363 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.22 
 
 
344 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  40.53 
 
 
349 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.46 
 
 
350 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.38 
 
 
390 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  39.13 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.34 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.06 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.06 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.06 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.94 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  39.18 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.4 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.06 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.4 
 
 
343 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.24 
 
 
349 aa  244  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.64 
 
 
344 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.06 
 
 
357 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.45 
 
 
349 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.96 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  38.86 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.47 
 
 
358 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.93 
 
 
354 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  41.48 
 
 
350 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  39.48 
 
 
357 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  40.46 
 
 
354 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.71 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  41.49 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.33 
 
 
355 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.71 
 
 
355 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  36.8 
 
 
362 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.8 
 
 
362 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.4 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  42.64 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.8 
 
 
362 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  36.27 
 
 
362 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.47 
 
 
369 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.57 
 
 
334 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.88 
 
 
344 aa  229  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  38.78 
 
 
346 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.81 
 
 
362 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.81 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  38.22 
 
 
343 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.29 
 
 
349 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.44 
 
 
344 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.66 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.52 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  40.97 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.27 
 
 
348 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  39 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.47 
 
 
344 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.79 
 
 
345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.73 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  40.73 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.43 
 
 
344 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.86 
 
 
349 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.43 
 
 
344 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  39.21 
 
 
350 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.42 
 
 
360 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.71 
 
 
344 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.9 
 
 
357 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.73 
 
 
344 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  44 
 
 
359 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  31.32 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 
375 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  39.15 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.33 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.33 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.43 
 
 
323 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.21 
 
 
347 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  27.51 
 
 
394 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.89 
 
 
410 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  36.89 
 
 
365 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.66 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  34.43 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  29.75 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  29.68 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.83 
 
 
320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.08 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  28.12 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.67 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.98 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  33.62 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>