More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_17730 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  100 
 
 		 466 aa  909    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  51.79 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  49.43 
 
 		 444 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  46.05 
 
 		 435 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  44.57 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  48.05 
 
 		 430 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  45.75 
 
 		 418 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  44.74 
 
 		 457 aa  358  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  42.76 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  46.82 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  44.62 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  45.85 
 
 		 424 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  45.64 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  45.93 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  44.22 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  46.56 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  45.64 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  44.52 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  46.54 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  42.73 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  46.67 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  44.34 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  43.86 
 
 		 431 aa  316  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  44.98 
 
 		 419 aa  315  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  35.93 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  33.17 
 
 		 416 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  33.08 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  31.91 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  33.95 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  33.95 
 
 		 406 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  32.43 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  31.16 
 
 		 393 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  32.51 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  31.81 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  32.05 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.77 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  31.95 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 398 aa  107  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  32.04 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 		 425 aa  93.6  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 378 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  31.69 
 
 		 403 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.5 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.68 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.34 
 
 		 382 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 389 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  32.08 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  31.02 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  30.35 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.64 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.02 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  31.47 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  31.1 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  28.9 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  31.5 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 373 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.19 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  34 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  29.19 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  29.19 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.02 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  22.54 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.59 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.13 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.86 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.59 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  23.46 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>