More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0297 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  718    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  51.6 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 		 414 aa  345  7e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.07 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  27.2 
 
 		 423 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.21 
 
 		 423 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  27.65 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  26.39 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.68 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 410 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  33.89 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  27.3 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  24.44 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  34.25 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.53 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  23.62 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  25.52 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.78 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  20.67 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  26.44 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.48 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  28.95 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  28.33 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  25.88 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  29.59 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.22 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.25 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  28.57 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.01 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.01 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  28.77 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.82 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  33.33 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.38 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.17 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.26 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 477 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  30 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.22 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  26.4 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.9 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.38 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.64 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>