126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5518 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  54.91 
 
 
176 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  54.91 
 
 
176 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  54.91 
 
 
176 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  51.45 
 
 
176 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  53.18 
 
 
176 aa  185  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  48.84 
 
 
173 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  47.67 
 
 
178 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  47.09 
 
 
176 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  47.09 
 
 
176 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  47.09 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  37.57 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  41.45 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  38.25 
 
 
229 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  38.12 
 
 
217 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
193 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 
190 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.37 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  35.8 
 
 
229 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.41 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  33.16 
 
 
194 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  39.86 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  34.97 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  30.32 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  29.92 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  29.5 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.99 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.24 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  30.91 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  27.33 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.66 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  31.11 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.86 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  26.39 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30.47 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  28.74 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.06 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.46 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  27.91 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  29.71 
 
 
180 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  30.5 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  29.32 
 
 
184 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  34.43 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  26.77 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  24.16 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  31.34 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  24.86 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  30.66 
 
 
178 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  30.66 
 
 
178 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  30.66 
 
 
178 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.53 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  28.1 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  46.94 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  32.35 
 
 
177 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.24 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  26.37 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  26.37 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.37 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  30.65 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  27.01 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  25.95 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  29.85 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  29.01 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.71 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  31.47 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  32.71 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 
190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 
190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 
190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  26.52 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  29.01 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  28.69 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.2 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  29.01 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.81 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>