More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2253 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 337 aa  689    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  64.99 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  64.69 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  65.66 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  67.06 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  56.76 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  58.16 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  51.03 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  51.62 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  52.21 
 
 		 338 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  51.32 
 
 		 340 aa  349  4e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  50.45 
 
 		 334 aa  340  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  50.6 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  50.75 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  50.3 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  50.15 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  52.79 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  49.13 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  46.5 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  45.22 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  43.32 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  43.03 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  44.98 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  41.5 
 
 		 351 aa  245  6e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  40.17 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  40.82 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  38.23 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.7 
 
 		 386 aa  192  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.38 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  33.24 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  31.11 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  30.47 
 
 		 389 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  29.27 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  28.42 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  25.63 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  30.77 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  34.4 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  26.71 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  25.99 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  24.91 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  26.74 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0494  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000368377  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  25.63 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0433  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000241052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  24.19 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  24.91 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1264  50S ribosomal protein L3  24.91 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00436289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  26.62 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  24.64 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  25.7 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  25.81 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0170  50S ribosomal protein L3  25.63 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000029478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  25.99 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  26.43 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  32 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  33.85 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  24.73 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  30 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  31.58 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3759  50S ribosomal protein L3  25.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000358076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  30 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0231  50S ribosomal protein L3  24.47 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  26.02 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  25.99 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  32.59 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0199  50S ribosomal protein L3  24.47 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000636858  unclonable  0.0000000000196513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0194  50S ribosomal protein L3  24.47 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000648086  decreased coverage  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0148  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000284118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0199  50S ribosomal protein L3  24.47 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000010724  hitchhiker  0.0000000019855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  24.91 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  25.63 
 
 		 212 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  27.46 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  27.08 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  30.61 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  31.2 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  32.26 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>