167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0809 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 331 aa  671    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  40.31 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  39.02 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  40 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  40.37 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  40 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  39.46 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  41.67 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  37.27 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  37.8 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  38.23 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  40.48 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  38.99 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  38.29 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  38.08 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  35.98 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  37.58 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  38.08 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  37.62 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  35.02 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  36.74 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  35.22 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  34.59 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  35.8 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  35.78 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  33.96 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.29 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  34.81 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  32.81 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  29.86 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  31.87 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  33.04 
 
 		 389 aa  173  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  31.96 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  30.67 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  28.4 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  31.33 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  27.86 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  29.93 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  29.93 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  30.23 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  29.2 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  30.87 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  30.95 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  29.87 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  28.99 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  31.16 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  30.43 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  31.65 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  30.43 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  30.83 
 
 		 210 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  43.86 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  31.62 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  26.25 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  30.05 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  29.77 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  27.74 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  28.26 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  28.78 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  28.26 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  28.99 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  46.88 
 
 		 207 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000554969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  30.95 
 
 		 212 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  28.26 
 
 		 218 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  32.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  30.83 
 
 		 207 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1975  50S ribosomal protein L3  35.06 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1988  50S ribosomal protein L3  35.06 
 
 		 236 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  28.47 
 
 		 215 aa  49.3  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1890  50S ribosomal protein L3  35.06 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  28.68 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  27.54 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  28.26 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  28.68 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  29.79 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  29.32 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  33.56 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  28.78 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  42.67 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  29.5 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  32.12 
 
 		 205 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  28.74 
 
 		 212 aa  47  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  28.68 
 
 		 209 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  29.76 
 
 		 212 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 212 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  26.14 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 212 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>