More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_6632 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 235 aa  207  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  50.95 
 
 		 268 aa  205  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 239 aa  204  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 317 aa  201  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 290 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  50.24 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 279 aa  195  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 238 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  50.46 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 246 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 246 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  49.76 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  47.62 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 211 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 241 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 211 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  44.93 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 241 aa  175  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  45.45 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  49.3 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06250  50S ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00608659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 247 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  45.67 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0050  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000105165  decreased coverage  1.58179e-26 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.83 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  45.67 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  46.8 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0053  50S ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000506419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>