More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0807 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 333 aa  673    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  74.55 
 
 		 334 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  73.05 
 
 		 334 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  72.46 
 
 		 334 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  72.46 
 
 		 334 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  50.75 
 
 		 337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  48.06 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  48.35 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  48.2 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  45.67 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  48.65 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  47.73 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  48.36 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  47.49 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  46.15 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  44.64 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  46.76 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  43.75 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  46.67 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  47.94 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  44.05 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  43.62 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  43.49 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  45.15 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  40.37 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  40.11 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  40.06 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  39.88 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.42 
 
 		 386 aa  210  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  32.79 
 
 		 390 aa  206  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  32.52 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  35 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  30.66 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  36.03 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  36 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  34.33 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  30.2 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  35.2 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  34.35 
 
 		 206 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  31.16 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  37.29 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  31.85 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  31.97 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  30.2 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  34.29 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  30.87 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  30.87 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  30.87 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  34.33 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  31.34 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  31.34 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  30.28 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  31.9 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  33.58 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  27.7 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  33.56 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  32.85 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  29.1 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  32.12 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  28.65 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  31.5 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  29.66 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  28.36 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  28.89 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  31.34 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  34.11 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  32.61 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  32.88 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  26.32 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  29.38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  29.85 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  29.41 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  31.21 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  30.37 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  35.71 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  28.89 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0170  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000029478  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  27.33 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  32.37 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  32.23 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  30.07 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  29.19 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  28.89 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>