213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0532 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 337 aa  686    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  70.03 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  64.99 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  69.73 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  63.55 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  55.79 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  54.3 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  48.38 
 
 		 338 aa  348  5e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  55 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  48.82 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 		 338 aa  338  7e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  51 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  49.56 
 
 		 340 aa  332  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  48.96 
 
 		 334 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  48.06 
 
 		 333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  48.66 
 
 		 334 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  48.66 
 
 		 334 aa  328  9e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  46.9 
 
 		 338 aa  326  5e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  48.07 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  44.27 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  43.79 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  42.6 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  43.99 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  41.36 
 
 		 351 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  42.94 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  43.54 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  39.65 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  37.8 
 
 		 331 aa  229  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.89 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  33.96 
 
 		 390 aa  185  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  33.43 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  33.24 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  31.52 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  23.4 
 
 		 243 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  24.4 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  25.36 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  25.9 
 
 		 212 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  26.07 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  24.56 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  25.27 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  28.36 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  23.66 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1264  50S ribosomal protein L3  24.29 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00436289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  26.87 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  26.35 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  24.82 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  25 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  25 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  25 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  24.1 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  23.02 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  22.94 
 
 		 209 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 216 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  24.38 
 
 		 220 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  27.61 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  23.38 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  29.23 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  21.58 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  29.27 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0231  50S ribosomal protein L3  23.32 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  25.71 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  24.55 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  25.36 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_0199  50S ribosomal protein L3  23.32 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000636858  unclonable  0.0000000000196513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0194  50S ribosomal protein L3  23.32 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000648086  decreased coverage  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0199  50S ribosomal protein L3  23.32 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000010724  hitchhiker  0.0000000019855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  24.01 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  23.02 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  23.38 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  23.02 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  27.54 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  23.74 
 
 		 212 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  22.83 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  29.55 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3795  50S ribosomal protein L3  22.3 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000167739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  28.78 
 
 		 211 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  21.15 
 
 		 208 aa  49.7  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  22.66 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  22.94 
 
 		 210 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  22.94 
 
 		 210 aa  49.7  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 210 aa  49.7  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  23.46 
 
 		 239 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  29.13 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  28.28 
 
 		 208 aa  49.3  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  28.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  22.97 
 
 		 239 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  25.54 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0170  50S ribosomal protein L3  23.02 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000029478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  22.58 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  27.41 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>