More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2292 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 338 aa  681    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  83.73 
 
 		 338 aa  590  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  77.51 
 
 		 338 aa  544  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  77.58 
 
 		 339 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  76.76 
 
 		 340 aa  531  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  51.03 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  48.67 
 
 		 337 aa  349  5e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  48.08 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  46.31 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  50.74 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  48.8 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  52.05 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  46.9 
 
 		 334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  46.9 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  46.84 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  45.43 
 
 		 334 aa  297  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  43.75 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  40.71 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  40.53 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  40.71 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  39.26 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  41.33 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  41.08 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  40.13 
 
 		 338 aa  215  7e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  38.82 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  35.22 
 
 		 331 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.96 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  34.71 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  32.97 
 
 		 390 aa  185  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  34.34 
 
 		 392 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  33.42 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  34.04 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  32.41 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  30 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  29.55 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  35.61 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  30.53 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  32.28 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  30.46 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  31.82 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  34.69 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  32.82 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  31.82 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  32.82 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  33.09 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  32.37 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  31.58 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  34.68 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  26.86 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  32.56 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  33.06 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  32.14 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  27.87 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  27.87 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  31.98 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  27.87 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  30.15 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  32.33 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  31.97 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  26.86 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  32.56 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  32.33 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  31.21 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  35.56 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  31.21 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  27.48 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  25.09 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  33.56 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  31.65 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  32.61 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  26.79 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  31.82 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  28.24 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  29.85 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  29.85 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 236 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  33.56 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  31.03 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>