247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0317 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 347 aa  696    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  63.37 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  59.88 
 
 		 342 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  60.29 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  60.69 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  49.12 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 351 aa  292  8e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  49.29 
 
 		 340 aa  281  8.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  41.21 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  42.94 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  42.82 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  41.79 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  44.8 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  41.91 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  40.92 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  43.61 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  40.63 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  40.17 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  40.35 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  40.11 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  41.67 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  43.52 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  42.82 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  43.35 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  41.04 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  41.33 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  43.64 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.55 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.34 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  33.62 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  34.01 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  33.24 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  34.27 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  31.39 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  34.27 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  43.69 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  32.58 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  37.63 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  32.61 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  30.83 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  31.54 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  27.08 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  32.58 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 220 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  36.63 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  31.34 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  28.89 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  31.15 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  39 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  32.84 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  30.99 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  33.58 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  31.72 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  41.11 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  35.25 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  28.39 
 
 		 238 aa  55.1  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  33.61 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  34.55 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  31.97 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  28.97 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  28.77 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  30.88 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  30.37 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 216 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  32.23 
 
 		 214 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  32.82 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  37.36 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  30.77 
 
 		 211 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  30.14 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  30.14 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  30.14 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 216 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  31.97 
 
 		 219 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0767  ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 236 aa  53.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.357159  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  31.15 
 
 		 217 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  30.37 
 
 		 218 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36377  Plastid ribosomal protein L3, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  32.79 
 
 		 241 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  34.95 
 
 		 212 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  30.5 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  25.83 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  31.2 
 
 		 229 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>