203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0442 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 337 aa  692    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  70.03 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  64.69 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  69.73 
 
 		 337 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  62.95 
 
 		 333 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  56.38 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  56.38 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  51.03 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  56.21 
 
 		 335 aa  361  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  50 
 
 		 339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 340 aa  349  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  48.67 
 
 		 338 aa  349  5e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  49.85 
 
 		 338 aa  345  6e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  50.15 
 
 		 334 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  49.7 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  47.98 
 
 		 340 aa  329  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  48.35 
 
 		 333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  48.95 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  44.08 
 
 		 338 aa  265  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  42.9 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  43.31 
 
 		 338 aa  259  6e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  45.75 
 
 		 334 aa  258  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  41.21 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  44.59 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  38.9 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  36.76 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  35.02 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  34.81 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.61 
 
 		 386 aa  196  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  34.51 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  32.04 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  32.34 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  26.06 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  31.91 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  23.19 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  24.45 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  35 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  26.64 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  30.95 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  26.24 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  29.69 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  24.45 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  23.91 
 
 		 208 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  22.42 
 
 		 216 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  28.1 
 
 		 212 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  33.57 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 209 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  26.15 
 
 		 210 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  25.99 
 
 		 216 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  27.74 
 
 		 212 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  22.5 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  22.5 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  25 
 
 		 220 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  24.82 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  27.86 
 
 		 238 aa  52.8  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  24.45 
 
 		 211 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  28.83 
 
 		 247 aa  52.8  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  29.56 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  26.24 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  31.43 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  32.61 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  28.12 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  31.39 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  24.82 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  30.41 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  24.64 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  30.88 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  24.28 
 
 		 212 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  26.64 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  29.5 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  31.85 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  26.28 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  29.73 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  26.28 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0231  50S ribosomal protein L3  27.8 
 
 		 212 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0199  50S ribosomal protein L3  27.8 
 
 		 212 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000636858  unclonable  0.0000000000196513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0194  50S ribosomal protein L3  27.8 
 
 		 212 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000648086  decreased coverage  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  26.28 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0199  50S ribosomal protein L3  27.8 
 
 		 212 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000010724  hitchhiker  0.0000000019855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0170  50S ribosomal protein L3  26.28 
 
 		 212 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000029478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3759  50S ribosomal protein L3  28.1 
 
 		 212 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000358076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0196  50S ribosomal protein L3  27.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4170  50S ribosomal protein L3  27.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0200  50S ribosomal protein L3  27.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000546138  unclonable  0.00000936811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>