247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2449 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 338 aa  685    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 339 aa  554  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  78.11 
 
 		 338 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  77.51 
 
 		 338 aa  544  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 340 aa  544  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  52.21 
 
 		 337 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  49.85 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  48.08 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  47.49 
 
 		 337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  46.9 
 
 		 337 aa  326  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 		 333 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  50.44 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  51.32 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  45.98 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  45.7 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  45.7 
 
 		 334 aa  291  8e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  45.4 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  45.1 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  44.05 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  42.01 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  40.53 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  41.12 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  43.35 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  40.45 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  41.72 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  37.93 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  38.66 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.51 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.79 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  34.81 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  33.06 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  34.6 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  33.7 
 
 		 389 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  30.4 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  29.17 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  26.79 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  25.62 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  26.43 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  24.82 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  27.37 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  30.6 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  24.1 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  29.37 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  33.07 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  23.3 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  23.66 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  31.2 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  25.61 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  26.37 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  28.8 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  26.13 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  26.13 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  30.77 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  34.13 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  26.13 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  27.18 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  31.45 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  29.37 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0394  50S ribosomal protein L3  31.54 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0369  50S ribosomal protein L3  31.54 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  25.78 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  28.8 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  32.33 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  25.26 
 
 		 218 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  31.75 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  31.75 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  23.74 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  22.58 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  25.45 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  31.21 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  31.55 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  29.63 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  29.92 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  23.02 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  32.58 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  31.2 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  31.71 
 
 		 236 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  23.76 
 
 		 207 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  23.76 
 
 		 207 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  31.75 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  28.35 
 
 		 210 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  29.85 
 
 		 210 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  29.61 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  24.21 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  28.57 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  32.56 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  22.86 
 
 		 205 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>