More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4524 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  100 
 
 
439 aa  863    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  78.89 
 
 
457 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  78.89 
 
 
457 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  78.89 
 
 
457 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  79.16 
 
 
430 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  50 
 
 
443 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  47.24 
 
 
482 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.59 
 
 
437 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
440 aa  352  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.57 
 
 
450 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
472 aa  348  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  46.27 
 
 
433 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.91 
 
 
468 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  42.52 
 
 
461 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  42.52 
 
 
461 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  42.52 
 
 
461 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 
442 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  44.63 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.85 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  42.01 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.2 
 
 
441 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 
461 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.65 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 
446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  41.51 
 
 
460 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  40.41 
 
 
443 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  40.05 
 
 
447 aa  315  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  41.16 
 
 
460 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  42.51 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  41.01 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
438 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  41.87 
 
 
438 aa  312  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  41.87 
 
 
438 aa  312  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  41.65 
 
 
445 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.42 
 
 
439 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.08 
 
 
430 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  41.01 
 
 
438 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  41.87 
 
 
438 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.87 
 
 
438 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  41.87 
 
 
438 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  42.33 
 
 
438 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  41.69 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  40.65 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.88 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.88 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.14 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.14 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.88 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.14 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  40.09 
 
 
450 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.42 
 
 
439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.37 
 
 
447 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  39.4 
 
 
484 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  40.71 
 
 
435 aa  309  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42.07 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  41.63 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  42.07 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  41.13 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  42.07 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.4 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  40.62 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  40.62 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  40.23 
 
 
463 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  42.45 
 
 
439 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  40.56 
 
 
453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  39.95 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  40.23 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 
435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.49 
 
 
441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.42 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  40.65 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  41.07 
 
 
429 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.23 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  40.4 
 
 
435 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  40.4 
 
 
435 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  41.72 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.04 
 
 
439 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  42.71 
 
 
442 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.56 
 
 
436 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.22 
 
 
438 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  43.3 
 
 
458 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.55 
 
 
439 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
431 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.88 
 
 
446 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.3 
 
 
439 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.07 
 
 
439 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.01 
 
 
441 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.3 
 
 
439 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.69 
 
 
450 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  42.48 
 
 
433 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  40.05 
 
 
439 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  40.05 
 
 
439 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  40.05 
 
 
439 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  43.23 
 
 
430 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  39.8 
 
 
439 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  44.47 
 
 
444 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  44.47 
 
 
444 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  44.47 
 
 
444 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  44.47 
 
 
444 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  44.47 
 
 
444 aa  292  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>