More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1578 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  99.19 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  88.66 
 
 		 244 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  83.84 
 
 		 250 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  78.95 
 
 		 227 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  77.62 
 
 		 227 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  65.3 
 
 		 232 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  63.43 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  59.01 
 
 		 224 aa  272  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  60.75 
 
 		 221 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  61.21 
 
 		 221 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  60.09 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  58.6 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  56.61 
 
 		 230 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  55.41 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  59.22 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  56.82 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  55.61 
 
 		 226 aa  251  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  55.61 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  60 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  57.28 
 
 		 219 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  56.81 
 
 		 219 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  54.17 
 
 		 218 aa  244  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  56.81 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  57.34 
 
 		 242 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  56.22 
 
 		 218 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  56.81 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  54.38 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  59.38 
 
 		 230 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  54.38 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  55.87 
 
 		 221 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  55.4 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  51.87 
 
 		 217 aa  228  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  60.31 
 
 		 214 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  56.41 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  55.87 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  52.29 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  48.1 
 
 		 226 aa  218  8.999999999999998e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  45.19 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  55.26 
 
 		 191 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  53.05 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  43.98 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  47.69 
 
 		 223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  46.93 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  45.54 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  47.18 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.22 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.29 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  43.61 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  45.33 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  47.18 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.11 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.61 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  42.59 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  39.82 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.41 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  40.85 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.25 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  43.29 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  47.6 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  40.61 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.96 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  44.69 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  44.3 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  47.6 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  47.6 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.25 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.3 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.42 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.34 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  40.53 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  45.61 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  47.16 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  39.82 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.95 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.22 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  39.82 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  41.92 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  41.92 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.34 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  45.13 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  41.92 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41.92 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  41.92 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>