More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2644 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
396 aa  813    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
382 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
442 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
389 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
377 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
441 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  30.57 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  30.57 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  30.57 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  30.57 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
500 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
383 aa  162  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
442 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
385 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
381 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  30.81 
 
 
436 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
391 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
447 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  31.15 
 
 
447 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
382 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
446 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
441 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
390 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
439 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
394 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  29.51 
 
 
442 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
444 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
388 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
444 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
444 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  30.77 
 
 
377 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
385 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27.66 
 
 
446 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.4 
 
 
390 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
441 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
441 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
444 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
393 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
447 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
385 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  27.27 
 
 
445 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
378 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
443 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
394 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  27.29 
 
 
460 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
384 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  29.37 
 
 
443 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
444 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
446 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
385 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
441 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
383 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
455 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
383 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.41 
 
 
380 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
423 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
441 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
430 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
442 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
441 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
441 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
388 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
443 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
441 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
386 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
441 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
385 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.67 
 
 
386 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
430 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
441 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
444 aa  136  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
430 aa  136  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>