More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0496 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  78.97 
 
 		 418 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  84.45 
 
 		 418 aa  735    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  77.02 
 
 		 418 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  100 
 
 		 418 aa  864    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  78.12 
 
 		 418 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  78.97 
 
 		 418 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  68.97 
 
 		 418 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  68.67 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  68.75 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  69.95 
 
 		 418 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  67.24 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  63.86 
 
 		 418 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  65.23 
 
 		 394 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  60.25 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  59.25 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  58.99 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  58.79 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  58.73 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  59.34 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  57.22 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  56.71 
 
 		 402 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  52.18 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  50.6 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  51.7 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  50.24 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  72.79 
 
 		 272 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0554  CP4-like integrase  72.1 
 
 		 274 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  45.13 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  44.52 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  40.56 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  36.88 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  36.88 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  36.88 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  37.44 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  38.83 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2105  integrase  82.35 
 
 		 149 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  35.71 
 
 		 410 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  34.86 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.61 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  35.1 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.35 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  35.1 
 
 		 390 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  35.47 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  33.82 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  33.82 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  34.07 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.31 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  32.67 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33.58 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  33.58 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.72 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  32.32 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.33 
 
 		 404 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.5 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 404 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  32.92 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  31.25 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  32.84 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  35.15 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  32.83 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  32.99 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  31.54 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  32.75 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  33.08 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  33.25 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  32.83 
 
 		 397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  32.26 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  32.41 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  32.84 
 
 		 404 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  31.68 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  30.23 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  31.91 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  32.33 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  32.33 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  31.23 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  33.66 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  30.13 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  31.84 
 
 		 417 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  31.57 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  31.83 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  31.25 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  31.78 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  32.91 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  31.25 
 
 		 391 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  30.63 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  33.24 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  32.27 
 
 		 445 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  29.8 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  33 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  32.19 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  30.49 
 
 		 429 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  30.39 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  30.59 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  30.1 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  30.29 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  29.44 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  29.23 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>