245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0015 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0015  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
304 aa  588  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.914534  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0112  regulatory protein DeoR  65.23 
 
 
301 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000859852  normal  0.215154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  27.9 
 
 
341 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.22 
 
 
347 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.78 
 
 
345 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.25 
 
 
344 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.66 
 
 
344 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.4 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  26.96 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.05 
 
 
343 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  25.59 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.68 
 
 
359 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.49 
 
 
350 aa  92  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.27 
 
 
359 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  28.12 
 
 
349 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.87 
 
 
344 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  23.98 
 
 
338 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.41 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  23.46 
 
 
338 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.44 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.19 
 
 
341 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  23.39 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.48 
 
 
348 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  23.75 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  23.68 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  23.39 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.9 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 
340 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  23.39 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  23.22 
 
 
339 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  23.1 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  23.1 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  23.39 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  22.91 
 
 
339 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.02 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  26.73 
 
 
339 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  27.88 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.46 
 
 
351 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  27.83 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  26.95 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.6 
 
 
351 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.17 
 
 
343 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  24.41 
 
 
357 aa  85.9  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.56 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.44 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  26.51 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.65 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.52 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  26.44 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.61 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.01 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.79 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  27.81 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  23.51 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.48 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26961  negative regulator of class I heat shock protein  29.25 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.86 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.53 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.86 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  26.33 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  32.45 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.09 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.58 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.38 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.03 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.33 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.55 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  27.27 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  26.61 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2417  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.73 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.14 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  25.76 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  29.79 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  26.2 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.69 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.22 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.71 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  25.45 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  25.45 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  25.45 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  25.45 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  25.45 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  25.45 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  25.45 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.54 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.24 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  23.71 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  24.01 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.71 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.69 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.99 
 
 
344 aa  79  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  28.73 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.73 
 
 
376 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  26.05 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  25.29 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.55 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  26.61 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>