248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0112 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0112  regulatory protein DeoR  100 
 
 
301 aa  599  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000859852  normal  0.215154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0015  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.23 
 
 
304 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.914534  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 
338 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  27.66 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  27.66 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.54 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.36 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  27.36 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.36 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  27.36 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.22 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  27.36 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.36 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  27.36 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  27.91 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.86 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.91 
 
 
344 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.79 
 
 
341 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.64 
 
 
352 aa  92.4  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  28.44 
 
 
349 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.41 
 
 
345 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.84 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  26.55 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.38 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  26.82 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.28 
 
 
345 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.04 
 
 
354 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  32.97 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.33 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  25.53 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.11 
 
 
344 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.6 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  27.02 
 
 
342 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  26.91 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.22 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.68 
 
 
347 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.97 
 
 
345 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  27.99 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.15 
 
 
351 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  29.34 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.49 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.58 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.85 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.33 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.65 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  27.79 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  26.43 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.13 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2417  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.51 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  27.54 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  27.24 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.42 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  25.81 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf618  heat-inducible transcription repressor  27.13 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.58742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  25.86 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.83 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  26.13 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.55 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.3 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.63 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  27.84 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26961  negative regulator of class I heat shock protein  30.72 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  26.84 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  26.11 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.79 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.15 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.65 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.95 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  26.43 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  25 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.21 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  25.53 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  34.32 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.65 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.92 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.92 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.31 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.45 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  26.77 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0207  heat-inducible transcription repressor  31.96 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  26.1 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  27.03 
 
 
334 aa  79  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0095  heat-inducible transcription repressor  23.6 
 
 
344 aa  79  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  26.48 
 
 
340 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.08 
 
 
348 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  33.73 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>