More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2310 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  100 
 
 		 216 aa  430  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  96.76 
 
 		 216 aa  421  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  67.76 
 
 		 217 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  57.23 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  53.4 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  52.36 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  56.79 
 
 		 168 aa  181  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  46.04 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  44.66 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  45.69 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  43 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  45.27 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  41.35 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  43.27 
 
 		 804 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  42.78 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  42.25 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  42.05 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  37.44 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  43.39 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  42.65 
 
 		 804 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.04 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  40.38 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.56 
 
 		 208 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  41.46 
 
 		 806 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  43.9 
 
 		 801 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  41.35 
 
 		 804 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  42.86 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  41.57 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.4 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.83 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.24 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  39.57 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  43.01 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  46.47 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  41.94 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  41.94 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  39.02 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  40.2 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  41.21 
 
 		 804 aa  141  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  40.2 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  38.89 
 
 		 607 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  41.54 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  41.24 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  41.5 
 
 		 818 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  44.33 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  40.82 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  38.55 
 
 		 556 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  38.89 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  37.32 
 
 		 813 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0813  methanol corrinoid protein  38.97 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  37.32 
 
 		 811 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  42.05 
 
 		 804 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.35 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  38.97 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  41.03 
 
 		 802 aa  134  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  39.18 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  36.79 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  40.51 
 
 		 800 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  43.23 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  36.23 
 
 		 807 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  40 
 
 		 841 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  37.63 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  38.46 
 
 		 841 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  37.56 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  36.71 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  39.79 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2142  corrinoid protein  53.66 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142295  normal  0.350048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.66 
 
 		 820 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  37.56 
 
 		 839 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  38.73 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  34.3 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  43.56 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  37.86 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3637  methanol corrinoid protein  38.07 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  37.44 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  35.83 
 
 		 768 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  36.36 
 
 		 768 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  35.64 
 
 		 804 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  34.62 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  38.24 
 
 		 803 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  38.3 
 
 		 780 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  33.81 
 
 		 774 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  36.65 
 
 		 1136 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  39.16 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.91 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.91 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.44 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  37.28 
 
 		 791 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  30.37 
 
 		 617 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  36.67 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  37.58 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  34.43 
 
 		 801 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  38.41 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  33.02 
 
 		 819 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  35.96 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.72 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  31.75 
 
 		 1236 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>