More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1760 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  56.07 
 
 
281 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  45.45 
 
 
282 aa  259  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  39.71 
 
 
279 aa  218  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  39.71 
 
 
277 aa  211  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  28.52 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  27.18 
 
 
282 aa  93.2  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.5 
 
 
877 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
873 aa  85.5  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  42.15 
 
 
907 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.8 
 
 
903 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  34.62 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  26.6 
 
 
427 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  39.67 
 
 
904 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  37.6 
 
 
909 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.59 
 
 
873 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 
863 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 
863 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  30.17 
 
 
867 aa  79.7  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.04 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  32.03 
 
 
907 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.76 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  36.77 
 
 
883 aa  76.6  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  37.19 
 
 
909 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  36.36 
 
 
865 aa  76.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
615 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.9 
 
 
413 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.54 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  27.37 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
885 aa  73.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.41 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.55 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  25.62 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  26.06 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  26.97 
 
 
433 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  23.74 
 
 
399 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 
615 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 
606 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
859 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  33.86 
 
 
158 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  37.07 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  26.83 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.61 
 
 
903 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  23.84 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  29.51 
 
 
880 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  34.15 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  33.1 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  32.12 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.14 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.99 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
615 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  31.97 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.88 
 
 
903 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.11 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30 
 
 
845 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  35.51 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
143 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  33.08 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  27.81 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  31.39 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.58 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.23 
 
 
615 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.23 
 
 
615 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  29.51 
 
 
143 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.23 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.14 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
230 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  35 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.78 
 
 
426 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  36.22 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  22.3 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  25 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.45 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  27.78 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.81 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  27.15 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  30 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.8 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>