More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3012 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 319 aa  648    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  71.3 
 
 		 286 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  56.1 
 
 		 252 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 246 aa  278  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  56.58 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  58.56 
 
 		 235 aa  263  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  56.14 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  56.14 
 
 		 234 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  53.81 
 
 		 234 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  53.81 
 
 		 234 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 248 aa  245  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  54.22 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  52.89 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50 
 
 		 231 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 265 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 238 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.44 
 
 		 230 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.55 
 
 		 235 aa  232  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  51.56 
 
 		 241 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.7 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  50.67 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.73 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  48.87 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.94 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.89 
 
 		 230 aa  230  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.91 
 
 		 237 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  51.11 
 
 		 249 aa  229  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 228 aa  228  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  52.05 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  51.29 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 229 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  47.98 
 
 		 233 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.68 
 
 		 225 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.12 
 
 		 228 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.09 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  50.92 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.11 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  49.77 
 
 		 260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.4 
 
 		 225 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 228 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.55 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 222 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.88 
 
 		 239 aa  225  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.39 
 
 		 237 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  46.67 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  51.34 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50.23 
 
 		 237 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  49.33 
 
 		 249 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.67 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  48.64 
 
 		 230 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  48.02 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  50.22 
 
 		 247 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 236 aa  222  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  49.09 
 
 		 244 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  48.18 
 
 		 236 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.38 
 
 		 642 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  50 
 
 		 248 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  51.12 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 240 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.7 
 
 		 240 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.64 
 
 		 238 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.7 
 
 		 240 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.32 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.7 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  49.56 
 
 		 228 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47.77 
 
 		 228 aa  219  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  51.89 
 
 		 241 aa  219  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  51.14 
 
 		 238 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  50.88 
 
 		 230 aa  219  6e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48 
 
 		 241 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.28 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.22 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.91 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.58 
 
 		 232 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  50.69 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.19 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  46.32 
 
 		 238 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  46.29 
 
 		 235 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.86 
 
 		 230 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 226 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  47.11 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 255 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 226 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 226 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 226 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 226 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 226 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>