271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0513 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  53.05 
 
 		 285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  44.16 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  33.81 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  34.64 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  34.29 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 288 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  37.01 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  34.39 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  31.39 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.97 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.1 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  29.86 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.58 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.96 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  27.63 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  27.63 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.33 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  25.84 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.13 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  29.47 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  22.64 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  26.21 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  26.36 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  26.86 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  23.59 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.7 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  24.62 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  25.88 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  25.78 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>