More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0036 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  60.36 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0198  peptide ABC transporter ATPase  57.08 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.630395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  52.97 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  52.97 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  49.55 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.5 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.16 
 
 		 277 aa  222  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  45.5 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  46.85 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  49.33 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  47.39 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  47.39 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  49.78 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  49.33 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.09 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.32 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.32 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  46.61 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.33 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  48.02 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.4 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.4 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  46.22 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.42 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.43 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.4 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  45.98 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  46.43 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  47 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.29 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  45.09 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  48.21 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  46.22 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.85 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 238 aa  207  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  46.4 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.3 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  47.98 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.98 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  47.56 
 
 		 715 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.88 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  46.73 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  44.69 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.19 
 
 		 653 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.88 
 
 		 640 aa  205  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.95 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  46.15 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  44.89 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  44.29 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  44.49 
 
 		 707 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.14 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45.95 
 
 		 642 aa  204  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  45 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  44.35 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.5 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  46.32 
 
 		 277 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  44.2 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  44.1 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.66 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>