More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0002 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 378 aa  755    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.05 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.41 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  48.43 
 
 		 376 aa  332  6e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.03 
 
 		 378 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.15 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  42.15 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  42.15 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  42.56 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  42.56 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.62 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.62 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  42.78 
 
 		 377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.95 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.93 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.78 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.25 
 
 		 381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  41.36 
 
 		 379 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.36 
 
 		 379 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.73 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.73 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  43.95 
 
 		 378 aa  299  6e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.67 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  35.08 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  35.34 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  34.82 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  34.82 
 
 		 376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  34.82 
 
 		 376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  34.82 
 
 		 376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 		 376 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.22 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  33.25 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.37 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.02 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.34 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  32.1 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.18 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.89 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.48 
 
 		 366 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  30.64 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.76 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.99 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.04 
 
 		 370 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.62 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.47 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.18 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.34 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.17 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  27.91 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  30.53 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  30.85 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  31.4 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.95 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.69 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.69 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.69 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.73 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.92 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.32 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.11 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.4 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.94 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  31.1 
 
 		 412 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  29.69 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.89 
 
 		 382 aa  159  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  30.73 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.1 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.01 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.89 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.65 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.36 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.91 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.8 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  27.79 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.24 
 
 		 374 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.6 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  29.27 
 
 		 372 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.13 
 
 		 372 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>