More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0167 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 393 aa  801    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  74.87 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  72.12 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  72.12 
 
 		 394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  72.63 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  58.72 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  58.97 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  58.78 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  58.29 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  58.02 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  60.71 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  57.61 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  56.31 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  57.22 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  57.07 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  57.07 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  55.82 
 
 		 408 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  57.75 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  49.35 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  39.22 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  38.86 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  39.21 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  38.06 
 
 		 406 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  38.37 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  38.76 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  38.21 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  38.69 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  38.06 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  37.44 
 
 		 418 aa  242  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  37.87 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  38.76 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  37.78 
 
 		 452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  37.21 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  36.97 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  37.69 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  37.28 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  37.63 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  37.22 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  37.11 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  37.19 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  36.93 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  36.27 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  37.11 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  37.11 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  37.31 
 
 		 462 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  33.77 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  33.25 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  34.5 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  34.37 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.24 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.25 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  30.74 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  30.35 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  31.04 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  34.43 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  29.06 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.54 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 362 aa  90.5  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  31.45 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.28 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 370 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30.63 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.88 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  30.56 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  29.77 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.38 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.42 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.59 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.02 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.72 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.05 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.8 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.05 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>