More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6019 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 		 365 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 353 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  34.9 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  28.9 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.83 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  27.04 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  28.61 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  29.21 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 344 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  28.3 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  24.03 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  31.31 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 330 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  23.21 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  22.19 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  26.79 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.21 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 385 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2050  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  27.01 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 335 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  26.1 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3527  helix-turn-helix domain-containing protein  28.96 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2211  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  27.96 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 333 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>