More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2535 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  37.33 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5282  LysR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  34.01 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3164  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2551  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521467  decreased coverage  0.00635729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.76 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  35.39 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  32.9 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  36.15 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3365  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.99 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  31.97 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  37.87 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 507 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>