More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1552 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  51.44 
 
 		 244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  51.56 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  49.8 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  46.53 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  44.07 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  47.22 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  44.21 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  45.45 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  43.32 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  44.17 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  45.19 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  46.94 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  43.98 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  46.31 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  46.12 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  45.49 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.23 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  44.96 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  43.33 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  42.51 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  43.7 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  47.44 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  39.67 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.98 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44.92 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.21 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  46.86 
 
 		 235 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.15 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  42.44 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  42.31 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  42.37 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  43.93 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  45.42 
 
 		 271 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  43.15 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  42.47 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  42.02 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 		 230 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  44.26 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  43.22 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.38 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  42.15 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.67 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  40.5 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  40.74 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  40.83 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  37.69 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  40.42 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  41.28 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  43.15 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  38.37 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  42.27 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.22 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  41.32 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  40.17 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  42.26 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  43.04 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  41.87 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  44.26 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  41.49 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  40.16 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.36 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  43.39 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.68 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  40.08 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  38.33 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.92 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.18 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.38 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  42.98 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.86 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.67 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.5 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  39.83 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.32 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  45.12 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  37.5 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  38.64 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  41.03 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  40.16 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  40.83 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  36.99 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  45.98 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  40.5 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  38.17 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  43.44 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  43.5 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  40.66 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.66 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  43.95 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  42.45 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  40.66 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  38.59 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.66 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  40.66 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>