More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1257 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.59 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 163 aa  97.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.97 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.19 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.78 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  34.03 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  35.86 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 		 182 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  29.19 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  32.37 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 358 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  32.3 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  33.59 
 
 		 174 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 169 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  29.14 
 
 		 357 aa  84  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  30.71 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  34.85 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  33.81 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  32.59 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  32.69 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  31.85 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  31.33 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  34.21 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  31.62 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  30.07 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  28.47 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  30.92 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  34.33 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  33.1 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  35.19 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  32.59 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>