98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0623 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.41 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  51.41 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.84 
 
 		 231 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.75 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  33.57 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.38 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  31.88 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  32.52 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  27.97 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.23 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  31.58 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  32.09 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  28.47 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  27.41 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.8 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  30.88 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  35.56 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  29.08 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  26.95 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  26.95 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  30.68 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  28.38 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  26.43 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  31.73 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.52 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.16 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  30.23 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  32.14 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.93 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  27.59 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.46 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3851  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0747223 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.75 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  29.93 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.03 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  31.11 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  28.46 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  31.58 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  29.5 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  26.35 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  29.76 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.48 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 128 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  34.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  28.16 
 
 		 151 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 151 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 151 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.68 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  30.59 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1561  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0537861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  28.32 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  29.41 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5112  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  28.77 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  30.26 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  30.26 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>