More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4870 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 814 aa  1643    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  65.33 
 
 		 726 aa  806    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.02 
 
 		 695 aa  727    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  58.94 
 
 		 680 aa  709    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 		 818 aa  399  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 819 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  35.19 
 
 		 810 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 		 817 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 816 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 807 aa  379  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  34.6 
 
 		 830 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  35.72 
 
 		 816 aa  376  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 840 aa  375  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  35.72 
 
 		 816 aa  376  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 816 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 828 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  36.74 
 
 		 880 aa  364  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 		 824 aa  362  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.58 
 
 		 720 aa  362  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  38.38 
 
 		 892 aa  356  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  36.34 
 
 		 773 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 		 830 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  34.61 
 
 		 831 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  34.61 
 
 		 831 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  35.89 
 
 		 739 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  34.56 
 
 		 801 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 820 aa  340  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 		 747 aa  340  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 871 aa  333  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 		 758 aa  333  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 766 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 758 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  34.09 
 
 		 744 aa  325  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 		 801 aa  323  9.000000000000001e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  35.4 
 
 		 693 aa  323  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  35.31 
 
 		 1057 aa  321  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 		 737 aa  320  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 		 877 aa  317  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  35.29 
 
 		 721 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 759 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  33.52 
 
 		 784 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  32.22 
 
 		 833 aa  310  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  33.09 
 
 		 740 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 		 808 aa  307  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  34.08 
 
 		 789 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.4 
 
 		 821 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.55 
 
 		 727 aa  298  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  32.04 
 
 		 821 aa  297  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.29 
 
 		 763 aa  297  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.27 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  35.31 
 
 		 807 aa  295  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 710 aa  294  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 710 aa  290  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 		 766 aa  289  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  33.94 
 
 		 772 aa  282  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 723 aa  282  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 648 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  35.07 
 
 		 710 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.64 
 
 		 817 aa  274  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.03 
 
 		 750 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  33.53 
 
 		 765 aa  272  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.5 
 
 		 776 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 736 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.4 
 
 		 761 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  34.97 
 
 		 722 aa  266  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 661 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  30.76 
 
 		 838 aa  264  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  34.45 
 
 		 726 aa  261  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.22 
 
 		 761 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 700 aa  259  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 703 aa  257  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.87 
 
 		 811 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.49 
 
 		 806 aa  253  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 		 761 aa  253  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 		 710 aa  251  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.66 
 
 		 723 aa  251  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 		 618 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  30.98 
 
 		 744 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.66 
 
 		 712 aa  248  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.58 
 
 		 727 aa  247  8e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  32.7 
 
 		 824 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.63 
 
 		 640 aa  246  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.52 
 
 		 640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 		 824 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  30.74 
 
 		 771 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.72 
 
 		 727 aa  244  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  30.99 
 
 		 773 aa  243  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.41 
 
 		 643 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  32.25 
 
 		 768 aa  242  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  32.18 
 
 		 658 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 		 643 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.6 
 
 		 643 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.08 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 708 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  34.7 
 
 		 734 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  30.23 
 
 		 751 aa  237  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  31 
 
 		 626 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 		 727 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 727 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.79 
 
 		 649 aa  235  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>