More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3692 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3692  PfkB domain protein  100 
 
 		 285 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  35.81 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  35.83 
 
 		 304 aa  98.6  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.88 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.46 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.89 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  33.59 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  33.46 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.92 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  34.93 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  30.83 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  30.08 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  32.11 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  33.74 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  35.44 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  26.82 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  32.47 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  36.21 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  31.34 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  30.65 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  31.95 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.67 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  31.32 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.33 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  28.36 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.15 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  29.9 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  28.36 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  27.76 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  33.09 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  34.31 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  20.62 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  31.2 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  30.49 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  25.56 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  29.1 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  25.56 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  30.96 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  31.27 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  27.44 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  34.15 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  20.43 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.52 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  30.63 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  30.29 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  28.2 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  28.25 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  20.48 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  33.98 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  32.16 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.09 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.28 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  30.57 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  23.86 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.3 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  31.99 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  30.13 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  32.05 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  27.06 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.54 
 
 		 322 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  28.22 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  28.42 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  30.39 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.96 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  34.96 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  30.54 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  31.36 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.1 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  32.22 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  22.81 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  22.81 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>