175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3313 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  64.12 
 
 		 577 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1152    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  42.91 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  42.73 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  42.91 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  42.91 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  42.73 
 
 		 580 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  42.91 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  42.91 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  42.69 
 
 		 580 aa  422  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  39.14 
 
 		 596 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  37.9 
 
 		 595 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  36.84 
 
 		 588 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  36.27 
 
 		 589 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  36.96 
 
 		 595 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  36.42 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  37.75 
 
 		 595 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  33.96 
 
 		 582 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  33.68 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  34.8 
 
 		 588 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  32.24 
 
 		 583 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  35.1 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  36.87 
 
 		 587 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  34.59 
 
 		 588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  34.7 
 
 		 588 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.58 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  35.6 
 
 		 588 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.01 
 
 		 588 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.45 
 
 		 588 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  32.07 
 
 		 606 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  32.07 
 
 		 606 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  35.94 
 
 		 526 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  36.67 
 
 		 606 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  36.21 
 
 		 608 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  34.4 
 
 		 517 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  30.11 
 
 		 617 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  30.11 
 
 		 617 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  34.48 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  32.46 
 
 		 610 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  32.79 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  31.47 
 
 		 606 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  29.76 
 
 		 616 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  29.76 
 
 		 616 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  29.76 
 
 		 616 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  31.47 
 
 		 606 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.28 
 
 		 590 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  30.81 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  31.32 
 
 		 606 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.95 
 
 		 590 aa  248  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  31.37 
 
 		 584 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  32.25 
 
 		 587 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  32.25 
 
 		 587 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  32.42 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  32.82 
 
 		 589 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  32.08 
 
 		 587 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  32.22 
 
 		 586 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  30.97 
 
 		 589 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  28.19 
 
 		 585 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  30.45 
 
 		 593 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  30.59 
 
 		 619 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  32.54 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  32.54 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  32.54 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  32.54 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  31.14 
 
 		 605 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0021  hypothetical protein  27.24 
 
 		 589 aa  211  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.864029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  30.22 
 
 		 619 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  32.54 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  32.07 
 
 		 623 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  32.38 
 
 		 623 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  32.22 
 
 		 623 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.1 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  31.59 
 
 		 623 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  29.51 
 
 		 611 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  29.51 
 
 		 611 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  29.51 
 
 		 611 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  29.79 
 
 		 611 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  29.98 
 
 		 612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  29.34 
 
 		 611 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  29.98 
 
 		 612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  29.98 
 
 		 612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  29.79 
 
 		 611 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  29.98 
 
 		 612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  30.07 
 
 		 612 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  29.45 
 
 		 612 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  30.82 
 
 		 619 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  29.72 
 
 		 611 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  29.95 
 
 		 592 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.24 
 
 		 612 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  30.43 
 
 		 629 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  30.48 
 
 		 620 aa  193  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  30.06 
 
 		 625 aa  191  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.1 
 
 		 624 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  26.42 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.76 
 
 		 647 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  29.65 
 
 		 629 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  30.59 
 
 		 629 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  30.44 
 
 		 629 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  29.55 
 
 		 629 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  30.59 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>