115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0275 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  78.39 
 
 		 789 aa  1216    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  100 
 
 		 790 aa  1572    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  27.53 
 
 		 518 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  27.24 
 
 		 520 aa  144  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  28.09 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  28.01 
 
 		 520 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  27.57 
 
 		 524 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 508 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  27.4 
 
 		 533 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  27.31 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  27.27 
 
 		 518 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  27.25 
 
 		 533 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  27.4 
 
 		 533 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  25.5 
 
 		 523 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  41.32 
 
 		 598 aa  114  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  26.9 
 
 		 534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  26.88 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  37.95 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  37.95 
 
 		 630 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  37.95 
 
 		 638 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  37.95 
 
 		 623 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  37.95 
 
 		 653 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  37.95 
 
 		 627 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  37.95 
 
 		 635 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  24.56 
 
 		 533 aa  111  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  27.99 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  25.53 
 
 		 530 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  28.42 
 
 		 480 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  22.56 
 
 		 469 aa  102  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  26.26 
 
 		 527 aa  97.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  24.54 
 
 		 469 aa  95.9  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  26.69 
 
 		 470 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  25.32 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  20.58 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  26.68 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  24.8 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  25.93 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  26.82 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  24.95 
 
 		 470 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.98 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  23.88 
 
 		 487 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  25.45 
 
 		 437 aa  72  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  26.37 
 
 		 470 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  24.5 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  24.45 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  27.22 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  24.45 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  27.71 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  25.82 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  23.88 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  27.24 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  23.63 
 
 		 434 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  24.44 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.9 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  33.87 
 
 		 366 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  34.68 
 
 		 366 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.1 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  30 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.77 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  31.19 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  34 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  38.38 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  38.61 
 
 		 344 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  37.62 
 
 		 343 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.43 
 
 		 363 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  42.37 
 
 		 371 aa  54.7  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  25.53 
 
 		 337 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  33.66 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  33.66 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  33.66 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  33.66 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  33.66 
 
 		 359 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  33.66 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  33.66 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  26.55 
 
 		 435 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  26.55 
 
 		 437 aa  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.46 
 
 		 369 aa  52  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  30 
 
 		 373 aa  51.6  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  29.23 
 
 		 369 aa  51.2  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  24.6 
 
 		 450 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  24.6 
 
 		 469 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  51.2  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  27.4 
 
 		 478 aa  50.8  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  24.6 
 
 		 450 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  25.46 
 
 		 791 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  32.69 
 
 		 354 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  27.43 
 
 		 454 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  29.37 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  32.35 
 
 		 341 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  27.43 
 
 		 453 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  26.71 
 
 		 478 aa  49.3  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  30 
 
 		 362 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  33.67 
 
 		 354 aa  48.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.35 
 
 		 339 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  28.46 
 
 		 373 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  28.46 
 
 		 373 aa  48.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  28.46 
 
 		 373 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  28.46 
 
 		 373 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  28.46 
 
 		 373 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  28.46 
 
 		 373 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>