284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2899 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  49.37 
 
 		 436 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  44.57 
 
 		 440 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  44.77 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  44.77 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  43.1 
 
 		 446 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  43.51 
 
 		 445 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  44.21 
 
 		 432 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  43.75 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  41.2 
 
 		 434 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  40.26 
 
 		 446 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 447 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 442 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 442 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 455 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 450 aa  89.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  32.54 
 
 		 470 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 476 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 450 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 728 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 464 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 463 aa  82.4  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 465 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  34.33 
 
 		 473 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 		 462 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 474 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 476 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  31.33 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  34.03 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 486 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  35.17 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  30.28 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.97 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 468 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 453 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 460 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  32.95 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  31.06 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  31.06 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 418 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  28.36 
 
 		 450 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  24.02 
 
 		 452 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 492 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.7 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.33 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 464 aa  62.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>