More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0767 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  854    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  55.39 
 
 		 438 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  55.15 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  55.88 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  53 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  53.03 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  52.41 
 
 		 435 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  53.24 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  52.76 
 
 		 429 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  57.29 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  57.07 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  55.05 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  54.09 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  52.53 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  54.02 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  54.29 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  54.02 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  54.02 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  56.47 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  54.22 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  52 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  53.98 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  53.3 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  51.61 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  53.98 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  54 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  50.96 
 
 		 476 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  54 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  53.6 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  54 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  54 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  52.56 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  54 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  52.84 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  51.67 
 
 		 487 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  52.84 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  54 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  50.96 
 
 		 476 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  53.69 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  53.44 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  52.55 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  49.63 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 441 aa  362  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  43.41 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  52.14 
 
 		 387 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  45.39 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  39.33 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  39.84 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  38.46 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  39.58 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  39.32 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  45.25 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  39.45 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  46.89 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  38.94 
 
 		 438 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  38.94 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  37.59 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  34.05 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  34.29 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  36.41 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  35.31 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.41 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  32.82 
 
 		 456 aa  209  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  34 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  35.7 
 
 		 444 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  35.4 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.4 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  34.78 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  30.91 
 
 		 482 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.41 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  29.41 
 
 		 485 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.66 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  29.41 
 
 		 485 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 485 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  33.91 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  29.18 
 
 		 483 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>