More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0743 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  262  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  96.97 
 
 		 132 aa  256  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  70.97 
 
 		 124 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  66.94 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  65.29 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  61.34 
 
 		 123 aa  146  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  50.88 
 
 		 230 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.31 
 
 		 228 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 235 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 231 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.16 
 
 		 310 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 186 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 229 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 233 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  50.48 
 
 		 278 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.8 
 
 		 230 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 231 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 230 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 231 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 234 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 227 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  38.93 
 
 		 235 aa  99.8  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  43.2 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 235 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 243 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 229 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.34 
 
 		 326 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 383 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  47.97 
 
 		 384 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 232 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 273 aa  97.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 235 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.27 
 
 		 238 aa  97.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 229 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.98 
 
 		 226 aa  97.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  43.2 
 
 		 406 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  41.32 
 
 		 234 aa  97.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 433 aa  97.1  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  42.99 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.34 
 
 		 231 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  43.75 
 
 		 236 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 231 aa  96.7  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 233 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 233 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 236 aa  95.9  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  43.75 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.54 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 		 500 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.54 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  42.62 
 
 		 248 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 216 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.68 
 
 		 454 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 232 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  36.89 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 232 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0013  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.06 
 
 		 314 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.992585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 231 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 231 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.83 
 
 		 457 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  50.48 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.45 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 443 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  42.54 
 
 		 454 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 227 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  40 
 
 		 163 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 248 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  41.8 
 
 		 248 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0174  response regulator receiver  36.75 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>