More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0888 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  88.81 
 
 
555 aa  1010  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  100 
 
 
553 aa  1118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  52.99 
 
 
554 aa  577  1e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  50.99 
 
 
558 aa  576  1e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  53.01 
 
 
553 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  50.53 
 
 
570 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  48.22 
 
 
564 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  49.2 
 
 
561 aa  525  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  48.7 
 
 
558 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  47.61 
 
 
571 aa  527  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  47.64 
 
 
553 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  50.27 
 
 
553 aa  519  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  46.26 
 
 
573 aa  517  1e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  47.13 
 
 
871 aa  516  1e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  46.75 
 
 
557 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  46.57 
 
 
556 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  46.67 
 
 
557 aa  505  1e-142  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  45.76 
 
 
571 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  46.14 
 
 
558 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.96 
 
 
568 aa  493  1e-138  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  47.27 
 
 
564 aa  494  1e-138  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  45.53 
 
 
787 aa  492  1e-138  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  45.97 
 
 
563 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  46.28 
 
 
561 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  46.25 
 
 
577 aa  488  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  46.8 
 
 
559 aa  486  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
568 aa  487  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  45.95 
 
 
562 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.29 
 
 
568 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.46 
 
 
568 aa  485  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  44.01 
 
 
566 aa  485  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  44.74 
 
 
561 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  45.88 
 
 
891 aa  482  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  46.15 
 
 
885 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
568 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.24 
 
 
568 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  43.87 
 
 
570 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  46.06 
 
 
599 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.61 
 
 
599 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  45.44 
 
 
599 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  45.34 
 
 
603 aa  471  1e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.11 
 
 
563 aa  470  1e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.85 
 
 
568 aa  467  1e-130  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  45.83 
 
 
888 aa  468  1e-130  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.03 
 
 
568 aa  466  1e-130  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.09 
 
 
568 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  45.92 
 
 
565 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
567 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.63 
 
 
571 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.09 
 
 
568 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  39.96 
 
 
561 aa  459  1e-128  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  45.52 
 
 
563 aa  459  1e-128  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  44.09 
 
 
568 aa  461  1e-128  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.39 
 
 
568 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  43.88 
 
 
578 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.73 
 
 
520 aa  453  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  43.86 
 
 
561 aa  452  1e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  43.29 
 
 
637 aa  452  1e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  42.12 
 
 
572 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  42.38 
 
 
573 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.21 
 
 
806 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  49.17 
 
 
514 aa  447  1e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  45.72 
 
 
554 aa  447  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.88 
 
 
520 aa  446  1e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  43.67 
 
 
589 aa  446  1e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  44.6 
 
 
563 aa  447  1e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  41.47 
 
 
823 aa  447  1e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  43.44 
 
 
591 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  43.56 
 
 
568 aa  440  1e-122  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  42.58 
 
 
569 aa  439  1e-122  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.65 
 
 
585 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.82 
 
 
521 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  44.2 
 
 
586 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.42 
 
 
575 aa  435  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.19 
 
 
578 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  51.96 
 
 
503 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  41.37 
 
 
570 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.21 
 
 
520 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.11826e-14 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  42.81 
 
 
577 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  40.28 
 
 
576 aa  431  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  6.42239e-05 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  40.49 
 
 
577 aa  432  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.21 
 
 
520 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  40.89 
 
 
565 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  41.32 
 
 
585 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  42.63 
 
 
584 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  41.44 
 
 
568 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.05 
 
 
580 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  41.38 
 
 
559 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  43.21 
 
 
587 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  40.49 
 
 
569 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  48.66 
 
 
501 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
561 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  40.46 
 
 
582 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  41.23 
 
 
610 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  43.73 
 
 
550 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  41.05 
 
 
562 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
746 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  42.14 
 
 
574 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  41.39 
 
 
587 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  40.67 
 
 
570 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>