More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0073 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0073  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  55.4 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  54.72 
 
 		 216 aa  238  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  49.53 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  33.86 
 
 		 255 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  35.92 
 
 		 252 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  34.13 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  33.86 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  34.41 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 255 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  32.64 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  32.53 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  32.64 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  32.5 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  31.69 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  35.63 
 
 		 257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  32.32 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  32.08 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 256 aa  124  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  32.79 
 
 		 252 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  31.56 
 
 		 269 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  33.61 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 266 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  32.08 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  37.19 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  30.8 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  39.08 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  29.28 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  31.15 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  30.37 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  29.55 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  30 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  29.89 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  31.03 
 
 		 278 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  32.8 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  30.19 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  34.82 
 
 		 263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  37.24 
 
 		 268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  31.2 
 
 		 252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  30.92 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  31.94 
 
 		 266 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  32.08 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  30.04 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  30.53 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  29.02 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  31.65 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  38.73 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  27.31 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  29.92 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  33.75 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  30.68 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  30.53 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  29.06 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  28.96 
 
 		 264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  28.03 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  28.3 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  28.03 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  29.17 
 
 		 270 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0391  dihydrodipicolinate reductase  36.99 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4712  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  28.14 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  34.94 
 
 		 252 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  33.65 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  27.27 
 
 		 270 aa  108  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  29.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  29.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  29.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  29.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  27.65 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  27.65 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  31.44 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28160  dihydrodipicolinate reductase  33.04 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.012111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  27.27 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  28.79 
 
 		 271 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  30.83 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  30.2 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  34.52 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  36.41 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  29.92 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0450  dihydrodipicolinate reductase  36.99 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  30.3 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  27.92 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  30.3 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>