More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2987 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 109 aa  223  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  66.06 
 
 		 109 aa  153  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  64.55 
 
 		 110 aa  146  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  59.63 
 
 		 109 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 108 aa  137  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  59.63 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  55.05 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  66.3 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  58.72 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  64.52 
 
 		 110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  65.22 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  64.52 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  46.99 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  53.52 
 
 		 97 aa  93.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  48.68 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  37.38 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  42.31 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.74 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  37.21 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  29.87 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.1 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  40.48 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  32.1 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  31.65 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  38.03 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  30.3 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  38.36 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>