More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0910 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0910  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
487 aa  996    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000977964  hitchhiker  0.000000000000772617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.55 
 
 
504 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.97 
 
 
489 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.54 
 
 
531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.16 
 
 
488 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.19 
 
 
472 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.17 
 
 
471 aa  196  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.89 
 
 
480 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.65 
 
 
481 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.51 
 
 
496 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.51 
 
 
496 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.6 
 
 
501 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.33 
 
 
486 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.51 
 
 
486 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.42 
 
 
473 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.82 
 
 
500 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.18 
 
 
470 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.17 
 
 
474 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.7 
 
 
469 aa  186  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.21 
 
 
508 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  31.21 
 
 
506 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  31.21 
 
 
508 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  31.21 
 
 
508 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.21 
 
 
508 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  31.21 
 
 
508 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.22 
 
 
485 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.73 
 
 
482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1620  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.94 
 
 
495 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.596211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.5 
 
 
483 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.01 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.13 
 
 
477 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.7 
 
 
483 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.7 
 
 
485 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.63 
 
 
464 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.1 
 
 
486 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.1 
 
 
486 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.86 
 
 
461 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
485 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  30.6 
 
 
460 aa  179  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  31.5 
 
 
470 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.43 
 
 
489 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.34 
 
 
514 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.39 
 
 
496 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.93 
 
 
495 aa  177  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  31.86 
 
 
514 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.88 
 
 
516 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  30.21 
 
 
491 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.85 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.83 
 
 
503 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  31.31 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.66 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.24 
 
 
496 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  31.33 
 
 
509 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.44 
 
 
504 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  33.25 
 
 
513 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.64 
 
 
515 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.55 
 
 
505 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.25 
 
 
499 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.59 
 
 
467 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.17 
 
 
475 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  28.6 
 
 
492 aa  170  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  30.4 
 
 
467 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  32.33 
 
 
516 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.2 
 
 
485 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  28.67 
 
 
460 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.86 
 
 
507 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.86 
 
 
507 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  30.4 
 
 
491 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  32.62 
 
 
516 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  32.62 
 
 
513 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  28.67 
 
 
460 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.53 
 
 
476 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.68 
 
 
544 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.03 
 
 
476 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.03 
 
 
476 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  28.21 
 
 
461 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.03 
 
 
476 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.12 
 
 
507 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.71 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  28.21 
 
 
461 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.54 
 
 
525 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.79 
 
 
477 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3369  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413443  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.85 
 
 
480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000857275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.53 
 
 
508 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229467  normal  0.0582449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  29.2 
 
 
497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.44 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.92 
 
 
486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.19 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  28.44 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  28.44 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  28.44 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  30 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  28.44 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.69 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2568  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.8 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  28.44 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>