More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0133 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
576 aa  1191    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  41.46 
 
 
601 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  39.1 
 
 
615 aa  435  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  38.68 
 
 
614 aa  435  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0348  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 
617 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.663793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 
617 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000589717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 
614 aa  420  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 
615 aa  405  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000266848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 
573 aa  332  9e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  33.39 
 
 
581 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
515 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 
566 aa  191  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.92 
 
 
520 aa  173  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 
532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 
534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.09 
 
 
509 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2203  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
872 aa  157  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000826446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
518 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.89 
 
 
541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.14 
 
 
546 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 
540 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.43 
 
 
535 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
527 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.95 
 
 
540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 
544 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
544 aa  147  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.14 
 
 
540 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
501 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.98 
 
 
520 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 
575 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
540 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 
501 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
516 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
521 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
531 aa  144  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 
523 aa  140  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.97 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.97 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.97 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
521 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.13 
 
 
532 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.35 
 
 
532 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
532 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.84 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  22.8 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
525 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.48 
 
 
538 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.62 
 
 
521 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 
495 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.73 
 
 
544 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
549 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
538 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
543 aa  133  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.1 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  23.51 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
535 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  25.36 
 
 
530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.1 
 
 
516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  23.1 
 
 
516 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  23.1 
 
 
516 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 
509 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.61 
 
 
558 aa  130  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.93 
 
 
516 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.93 
 
 
516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1562  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.278775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  23.33 
 
 
532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  25.42 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.88 
 
 
550 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.89 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
532 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.45 
 
 
526 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
501 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
538 aa  127  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 
556 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 
537 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 
557 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
531 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
538 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  22.54 
 
 
556 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 
563 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
558 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 
588 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 
529 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
525 aa  124  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 
506 aa  124  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.86 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  23.11 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  25.05 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 
544 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>