298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0004 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 420 aa  850    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  47.73 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  44.2 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.84 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  30.81 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  30.81 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  30.81 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  30.54 
 
 		 375 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  30.54 
 
 		 375 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  30.54 
 
 		 375 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 374 aa  186  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  30.54 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  30.54 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  30.54 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.51 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  33.6 
 
 		 371 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  31.47 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  33.42 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  31 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  33.33 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  30.89 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.96 
 
 		 373 aa  176  9e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  29.86 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  29.86 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  29.4 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.68 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  30.46 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  30.9 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  35.88 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.43 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  31.62 
 
 		 364 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  31.65 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.84 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  31.95 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  33.07 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.89 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  33.77 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  31.35 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  33.81 
 
 		 363 aa  156  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  30.23 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  33.25 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  32.15 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  29.89 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.18 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.18 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  33.25 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  33.25 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.47 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  33.53 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.51 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  33.88 
 
 		 386 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.53 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  34.07 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.19 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  28.78 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  33.24 
 
 		 380 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  33.24 
 
 		 380 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  31.34 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.57 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.14 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  30.92 
 
 		 365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  33.51 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  29.36 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.08 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  32.96 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.8 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.39 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  32.75 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  34.04 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.63 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.64 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.44 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  30.81 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.84 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.63 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  32.14 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.83 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.67 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.69 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.64 
 
 		 362 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.08 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  28.16 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.48 
 
 		 371 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  28.65 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  25.31 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.81 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.18 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  30.57 
 
 		 368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  31.19 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.95 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  32.78 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.61 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.39 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  29.15 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  31.09 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.45 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>