More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0649 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  97.79 
 
 		 633 aa  1256    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  94.42 
 
 		 702 aa  1045    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  94.05 
 
 		 702 aa  1041    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  91.82 
 
 		 713 aa  1018    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  81.41 
 
 		 704 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  98.1 
 
 		 633 aa  1299    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  92.63 
 
 		 713 aa  1015    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  98.1 
 
 		 633 aa  1298    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  91.82 
 
 		 702 aa  1017    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 633 aa  1320    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  81.41 
 
 		 713 aa  947    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  92.63 
 
 		 713 aa  1015    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  46.92 
 
 		 732 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  45.77 
 
 		 740 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  47.68 
 
 		 741 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  45.61 
 
 		 740 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  47.68 
 
 		 741 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  46.21 
 
 		 725 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  41.58 
 
 		 617 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  41.42 
 
 		 617 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  41.58 
 
 		 617 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  40.52 
 
 		 609 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  43.21 
 
 		 615 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  43.01 
 
 		 618 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  40.19 
 
 		 616 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  43.74 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  41.98 
 
 		 619 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  43.78 
 
 		 617 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  42.7 
 
 		 656 aa  458  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  43.16 
 
 		 678 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  42.97 
 
 		 678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  42.7 
 
 		 655 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  40.75 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  39.66 
 
 		 687 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  40.84 
 
 		 694 aa  439  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  39.66 
 
 		 687 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  40.03 
 
 		 723 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  39.66 
 
 		 687 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  39.9 
 
 		 1095 aa  429  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  37.16 
 
 		 682 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  38.65 
 
 		 699 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  40.22 
 
 		 694 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  39.11 
 
 		 655 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  41.58 
 
 		 706 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  37.79 
 
 		 1017 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  38.8 
 
 		 726 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  40.89 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  40.22 
 
 		 722 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  35.25 
 
 		 725 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  38.25 
 
 		 722 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  39.46 
 
 		 725 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  37.61 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  37.81 
 
 		 771 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  36.13 
 
 		 697 aa  357  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  36.63 
 
 		 727 aa  352  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  36.68 
 
 		 706 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  39.96 
 
 		 1019 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  38.35 
 
 		 1019 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  38.35 
 
 		 842 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  35.73 
 
 		 709 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.12 
 
 		 683 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  35.12 
 
 		 689 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  34.2 
 
 		 741 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 907 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.83 
 
 		 774 aa  320  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  34.72 
 
 		 741 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  34.38 
 
 		 689 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.49 
 
 		 683 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 748 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.07 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  32.76 
 
 		 680 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 		 755 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  34.77 
 
 		 788 aa  313  7.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  32.97 
 
 		 790 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  32.11 
 
 		 643 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  32.61 
 
 		 680 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 680 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  31.8 
 
 		 646 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  33.83 
 
 		 730 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  33.57 
 
 		 754 aa  306  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 694 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  32.62 
 
 		 684 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  31.67 
 
 		 702 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.88 
 
 		 756 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  33.45 
 
 		 754 aa  303  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.45 
 
 		 692 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 572 aa  302  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.41 
 
 		 785 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  32.13 
 
 		 693 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 741 aa  300  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.16 
 
 		 692 aa  299  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  34.2 
 
 		 921 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.64 
 
 		 778 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  32.85 
 
 		 771 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 		 731 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  33.27 
 
 		 734 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  31.38 
 
 		 618 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  33.16 
 
 		 794 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  33.27 
 
 		 734 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  33.27 
 
 		 734 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>