90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2219 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  31.82 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.82 
 
 		 244 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  33.18 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.96 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.49 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.49 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.51 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.57 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.59 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  29.61 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.34 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.73 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  29.23 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.69 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.11 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.16 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.05 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  28.99 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.27 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  32.42 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  32.61 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.4 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.2 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.86 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  32.22 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  28.96 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  27.55 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.16 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  28.25 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  32.95 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.92 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  25.64 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  26.63 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  28.96 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  25.25 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  28.98 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  29.56 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  27.14 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  27.14 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  37.27 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  37.93 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  24.75 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  29.38 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  27.75 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  26.97 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  40 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  26.63 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  28.43 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  23.66 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  37.29 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  41.03 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  28.16 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  31.07 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  22.83 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  25.12 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  40 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  25.53 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  41.56 
 
 		 388 aa  48.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.03 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  27.68 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  27.36 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  42.5 
 
 		 327 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  24.87 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.56 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  37.76 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  26.55 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.29 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  34.69 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  29.31 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  39.39 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  35.23 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  25.73 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.9 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  24.58 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.05 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  31.29 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  35.54 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  31.25 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  40.22 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  43.21 
 
 		 284 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  37.11 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  28.65 
 
 		 193 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  36.52 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  36.52 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  35.48 
 
 		 255 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2030  nuclease  37.89 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000391548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>