64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0713 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  34.78 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.53 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.52 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.54 
 
 		 336 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  31.87 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  33.01 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  35.29 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.14 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  27.76 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  31.63 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.46 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.79 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.35 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  25.34 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  27.27 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.71 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  25.71 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.14 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  31.69 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  31.51 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.57 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  27.12 
 
 		 471 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  28.42 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  28.69 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  27.78 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  22.87 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  27.37 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  37.76 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.97 
 
 		 451 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.72 
 
 		 464 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  25.14 
 
 		 795 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  26.54 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  27.46 
 
 		 436 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  29.88 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  30.99 
 
 		 442 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.69 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.58 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.95 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  27.69 
 
 		 361 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  28.09 
 
 		 331 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  29.21 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0717  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  31.62 
 
 		 362 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  33.64 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.15 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.19 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_249  predicted protein  34.19 
 
 		 835 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  23.84 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  26 
 
 		 432 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  31.45 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  25.47 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  26.39 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  28.19 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0846  hypothetical protein  36.29 
 
 		 841 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.826498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  26.09 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  26.12 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  29.71 
 
 		 226 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  28.49 
 
 		 223 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  24.46 
 
 		 422 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36290  prolyl oligopeptidase family protein  29.41 
 
 		 609 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278406  normal  0.444114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>