More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0486 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  100 
 
 		 361 aa  742    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  61.94 
 
 		 360 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  60.51 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  53.23 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  53.13 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  48.14 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  49.06 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  47.25 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  45.65 
 
 		 383 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  42.06 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  45.06 
 
 		 385 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  45.17 
 
 		 389 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  43.09 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  42.65 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  47.62 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  46.67 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  42.65 
 
 		 382 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  44.7 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  43.66 
 
 		 383 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  41.55 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  43.71 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  41.35 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.78 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  43.41 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  40.46 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  40.82 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.57 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  41.45 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  40.75 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  44.04 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  44.04 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  39.74 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  45.66 
 
 		 309 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  43.06 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  40.65 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  37.12 
 
 		 503 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  40.66 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  41.14 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  41.14 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  39.68 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  37.01 
 
 		 459 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.07 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  40.62 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  37.58 
 
 		 447 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.46 
 
 		 498 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  37.97 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  37.01 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.22 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.22 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  35.93 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  38.83 
 
 		 379 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  36.53 
 
 		 386 aa  215  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  38.44 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  37.22 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  37.46 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  37.26 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  38.46 
 
 		 475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  35.33 
 
 		 464 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.62 
 
 		 471 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  38.98 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  38.26 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  39.73 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  38.8 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  37.42 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  38.26 
 
 		 457 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  35.99 
 
 		 474 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.84 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  39.63 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  35.55 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  38.01 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  35.55 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  35.55 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  35.53 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  37.18 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  36.31 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  33.53 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  36.49 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  36.73 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.74 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  36.62 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  35.87 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  37.07 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  37.95 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  34.43 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  35.83 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  37.5 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.55 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  35.58 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.37 
 
 		 381 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  35.58 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  37.29 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  34.03 
 
 		 386 aa  202  5e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  37.5 
 
 		 445 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  35.62 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  37.18 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  37.18 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  37.18 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  37.18 
 
 		 454 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  35.84 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  37.18 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>