More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1803 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 708 aa  1465    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  38.37 
 
 		 806 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.71 
 
 		 643 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 643 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 643 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.8 
 
 		 618 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 		 654 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 765 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.49 
 
 		 648 aa  351  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  35.37 
 
 		 640 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.32 
 
 		 751 aa  347  4e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 828 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.3 
 
 		 648 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.78 
 
 		 727 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 640 aa  343  9e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.14 
 
 		 727 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  36.98 
 
 		 709 aa  339  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 661 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.29 
 
 		 814 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.33 
 
 		 667 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  36.67 
 
 		 801 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.73 
 
 		 761 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.46 
 
 		 714 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.03 
 
 		 625 aa  332  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  34.89 
 
 		 855 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.35 
 
 		 761 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.83 
 
 		 649 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.83 
 
 		 638 aa  327  5e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 795 aa  327  6e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.04 
 
 		 811 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 861 aa  326  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.64 
 
 		 662 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  33.61 
 
 		 728 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  35.39 
 
 		 905 aa  324  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 		 714 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 727 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  32.9 
 
 		 727 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  34.81 
 
 		 642 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.07 
 
 		 777 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  34.83 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  35.47 
 
 		 705 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 		 693 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  35.47 
 
 		 705 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  35.47 
 
 		 705 aa  317  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 746 aa  316  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.66 
 
 		 712 aa  316  8e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.16 
 
 		 728 aa  316  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  35.47 
 
 		 705 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.52 
 
 		 824 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  35.47 
 
 		 705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  36.58 
 
 		 860 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.61 
 
 		 641 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.68 
 
 		 776 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  34.38 
 
 		 644 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.35 
 
 		 824 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.47 
 
 		 705 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  34.33 
 
 		 734 aa  313  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.82 
 
 		 775 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 		 744 aa  313  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  35.29 
 
 		 705 aa  313  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  33.57 
 
 		 645 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  32.46 
 
 		 642 aa  310  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.74 
 
 		 679 aa  311  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 741 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  35.22 
 
 		 746 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  34.2 
 
 		 705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  31.48 
 
 		 707 aa  308  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.71 
 
 		 687 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  33.93 
 
 		 853 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.98 
 
 		 732 aa  306  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  31.96 
 
 		 709 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  31.96 
 
 		 709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  32.26 
 
 		 646 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  31.96 
 
 		 709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.86 
 
 		 626 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  33.89 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  34.74 
 
 		 817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.49 
 
 		 734 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.69 
 
 		 691 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  34.21 
 
 		 980 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  30.7 
 
 		 880 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.08 
 
 		 701 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  33.13 
 
 		 669 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  34.41 
 
 		 952 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  32.11 
 
 		 705 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.61 
 
 		 739 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  35.06 
 
 		 656 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  34.33 
 
 		 643 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  34.33 
 
 		 643 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 		 941 aa  300  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.81 
 
 		 710 aa  300  6e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 714 aa  300  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 		 718 aa  300  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.01 
 
 		 658 aa  300  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.51 
 
 		 742 aa  300  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  35.39 
 
 		 744 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 714 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.37 
 
 		 686 aa  296  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  35.79 
 
 		 681 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>