66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0082 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 567 aa  1147    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  34.3 
 
 		 536 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  30.12 
 
 		 545 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.69 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  28.87 
 
 		 481 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  27.26 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  21.43 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  20.45 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  21.82 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  18.83 
 
 		 523 aa  93.6  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  21.88 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21430  hypothetical protein  22.34 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  51.61 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  26.34 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  21.43 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  25.81 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  55.1 
 
 		 191 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 221 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  56.82 
 
 		 332 aa  54.7  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  52.08 
 
 		 335 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 411 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  35.63 
 
 		 307 aa  54.3  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2917  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  56.86 
 
 		 156 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  53.33 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  37.18 
 
 		 128 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  43.59 
 
 		 159 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  43.1 
 
 		 205 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  41.43 
 
 		 301 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2270  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  41.3 
 
 		 330 aa  48.9  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 341 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  43.1 
 
 		 303 aa  48.9  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  43.18 
 
 		 739 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  48.94 
 
 		 372 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.37 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  48.94 
 
 		 372 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  36.05 
 
 		 168 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2271  hypothetical protein  32.95 
 
 		 173 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  45.45 
 
 		 739 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  37.18 
 
 		 109 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 709 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  41.56 
 
 		 202 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 130 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.98 
 
 		 289 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 304 aa  47.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  53.33 
 
 		 75 aa  47  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0837  hypothetical protein  25.71 
 
 		 144 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.847537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 123 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  45.16 
 
 		 173 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.94 
 
 		 230 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  40.82 
 
 		 442 aa  47  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.98 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1855  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 		 208 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.653374  normal  0.622298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1315  peptidoglycan-binding LysM  36.9 
 
 		 148 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.25781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  27.59 
 
 		 142 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.65 
 
 		 470 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 		 560 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 744 aa  44.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1818  peptidase M23B  38 
 
 		 286 aa  44.3  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  48.89 
 
 		 491 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  42.22 
 
 		 179 aa  43.5  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  30.43 
 
 		 187 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  43.48 
 
 		 423 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>